本发明提供了一种内窥镜系统及其光源装置，光强检测模组实时检测被第一合光片反射的小部分第一颜色光的光强值和被第一合光片透射的小部分第二颜色光的光强值，将第一颜色光的光强值转换为第一电压值、将第二颜色光的光强值转换为第二电压值，并实时反馈给光源控制模组，以使光源控制模组对第一光源模组和/或第二光源模组进行调节，使得颜色光的光强值与基准光强值一致，从而可以避免混合光的色调偏离原有的数值，进而可以保证长期使用过程中混合光的色调的稳定性。并且，由于光强检测模组位于被第一合光片反射的小部分第一颜色光和被第一合光片透射的小部分第二颜色光形成的待检测光的光路上，因此，可以在不影响合光的情况下，进行光强的检测。