本发明提供了一种保偏光纤端面对轴装置及方法。所述端面对轴装置包括显微镜、照明光源、十字载物台、对轴控制模块、定轴控制模块和执行机构；其中显微镜目镜视场设有基准线，端面切割处理后的保偏光纤由对轴控制模块的夹具夹持，将待对轴保偏光纤端面置于显微物镜下；照明光源用于对保偏光纤侧面包层进行打光照明，使得待对轴保偏光纤端面应力区出现在显微物镜视场内；对轴控制模块与十字载物台固定连接，执行机构用于通过调节十字载物台带动对轴控制模块转动，使保偏光纤端面应力区轮廓与显微镜目镜视场内的基准线相切，实现光纤端面与基准线对轴，定轴控制模块用于通过夹具夹持板夹持已完成对轴的保偏光纤，完成光纤端面与基准线定轴。