本发明涉及一种玻片厚度自动调整机构及显微镜，该玻片厚度自动调整机构包括载玻台和弹片，载玻台设有用于沿水平方向卡住玻片两侧边沿的两个卡位槽，卡位槽在从外侧向里侧延伸的方向上依次分为导入区域和待检区域；弹片设于卡位槽的底壁上，且弹片的顶起端朝向待检区域设置，用于在玻片从导入区域推入至待检区域时从玻片的底部顶起玻片以抵接卡位槽的内顶壁。该玻片厚度自动调整机构通过对用于卡住玻片的卡位槽设置弹片，可利用弹片的顶起部的作用力将玻片顶起，进而使玻片上表面的边沿始终抵接卡位槽的内顶壁，从而保证置于不同厚度的玻片上的样品都可在同一高度上检测，从而可显著缩短对焦时间，提高对焦效率，提高检测效率。