本发明公开了一种生物测量仪零点臂调试装置及方法。该方法包括：通过经纬仪以及五棱镜调整第一自准直仪以及第二自准直仪的位置；通过调试反射镜使第一自准直仪的光轴与准直器光轴平行；通过第一自准直仪以及第二自准直仪，调整半反半透镜的位置，使半反半透镜与准直器光轴的夹角为45°；通过半反半透镜、第一自准直仪以及第二自准直仪调整第一反射镜的位置，使第一反射镜与半反半透镜平行；通过固定好的半反半透镜以及第一自准直仪调整第二反射镜的位置，使第二反射镜与半反半透镜夹角为90°；通过半反半透镜、第一自准直仪以及第二反射镜调整第三反射镜的位置。本发明调试方法操作简单，省时省力，能够准确的使光线能按原路返回，误差小。