本发明提供了一种微小孔电火花-电解异区同步复合加工方法及其专用工具，管电极上通有脉冲电压，超低浓度中性盐溶液通过管电极内部高速流入加工区域，然后沿管电极与工件之间的间隙流出加工区域；超低浓度中性盐溶液在高压脉冲的作用下，在管电极的端面实现电火花轴向进给高速穿孔加工，在低压脉冲的作用下，对电火花加工后的孔壁进行径向电解光整加工。本发明采用电火花-电解异区同步复合加工方式，既保证了加工精度，又提高了制孔效率，满足了航空发动机各种孔的加工要求。本发明采用超低浓度中性盐溶液，区别于传统的电火花加工和电解加工，可以大幅度提高电化学溶解时的加工效率并减少设备的腐蚀程度。