本申请提供一种采用分组对称密钥算法对多消息并行加解密方法，寄存器的大小为M，基本运算单元大小为N，则可同时处理k＝M/N个来自不同消息的数据。其步骤包括：将k个来自不同消息的数据分别放入k个分组数据块中，每个分组数据块大小与寄存器大小相同；将每个分组数据块中的数据分为k段，将k个分组数据中的第i段依次串联后放入第i个寄存器变量中，对第i个寄存器变量执行加密，将寄存器变量中加密后的数据分为k段，将每个寄存器中的第j段进行串联后获得第j组明文的加密结果；解密方法与加密方法相似。本发明通过并行不同消息的数据块，避免了当前常用并行模式处理短消息时的大量填充，最大化分组算法的吞吐量。