一种集装箱式光伏发电系统，属于光伏发电技术领域。本发明包括集装箱、第一光伏组件、第二光伏组件、太阳跟踪传感器和控制器，集装箱的左右两侧分别设有用于闭合或敞开集装箱左右两侧的第一封盖机构，集装箱的顶端设有用于闭合或敞开集装箱顶端的第二封盖机构，集装箱内固定安装有隔板，隔板将集装箱内的空间分隔成上层容纳腔和下层容纳腔，第一光伏组件位于上层容纳腔内，第二光伏组件分别位于下层容纳腔内的左右两侧。本发明将第一光伏组件和第二光伏组件收纳在集装箱内，实现了发电装置的整体运输，提高了机动性，降低了运输成本，解决了现有光伏电站无法移动、必须在安装地现场安装的弊端。