本发明提供一种高压断路器本体三相不一致保护二次回路结构，包括设置于断路器控制箱内的高压断路器三相不一致起动回路、设置于继保室保护屏内的时间继电器以及预置于继保室保护屏断路器操作箱内跳闸继电器回路上的跳闸继电器；起动回路将正电引入时间继电器的线圈正负电端以及经时间继电器常开时间接点引入跳闸继电器线圈正负电端后分别至负电；同时跳闸继电器常开接点与高压断路器连成回路；高压断路器三相分合闸状态不同步时，自动接通起动回路，时间继电器通电延时启动使跳闸继电器常开接点闭合，实现高压断路器三相跳开。实施本发明，对高压断路器本体三相不一致保护回路进行改进，提高保护动作可靠性，防止运行中误动和拒动。