本发明公开了一种电荷泵系统、控制电路及其数字控制方法，包括：差分放大器，用于接收反馈电压和参考电压，并生成输出信号；振荡电路，用于生成时钟脉冲；电荷泵，用于接收所述时钟脉冲，并生成输出电压；与所述电荷泵的输出相连的汲流源；第一对共源共栅晶体管，用于生成数字信号；以及反相器，用于根据所述输出信号，将所述数字信号反向，以生成第一数字信号，其中，该第一数字信号输入至所述汲流源。当所述反馈电压高于所述参考电压时，生成所述第一数字信号，并导通所述汲流源。当所述反馈电压低于所述参考电压时，不生成所述第一数字信号，并关闭所述汲流源。