本发明实施例公开了一种安全控制方法以及安全处理器、计算机系统，所述方法包括:安全处理器接收来自主处理器的安全模式设置请求，所述设置请求包括程序主体的标识以及所述程序主体的安全模式；根据所述安全模式设置请求，更新与所述程序主体的标识对应的安全信息表项；其中，安全信息表存储有与程序主体相关联的所述安全信息表项，所述安全信息表项存储有程序主体的安全模式，所述安全模式用于指示所述程序主体的运行方式。本发明实施例中的技术方案可以提升计算机系统的安全性，以及提升对不同程序主体进行安全控制的通用性和兼容性。