本发明提供一种风扇控制电路及风扇控制系统，适用于服务器，所述风扇控制电路包括：一风扇控制器，与至少一个风扇连接器相连，且通过集成电路总线通信线与一基板管理控制器相连并输出一基板管理控制器风扇信号，所述风扇控制器由主供电电源供电；一基板状态检测电路，分别与所述基板管理控制器和所述风扇控制器相连，检测所述基板管理控制器的心跳信号，并根据所述心跳信号控制输出风扇脉冲信号，以控制与所述风扇连接器相连的风扇正常工作。本发明除了考虑到基板管理控制器(BMC)的以及风扇的N+1冗余外，还兼顾对整个风扇控制系统的各个环节进行异常检测和保护，在风扇控制系统异常时提供更有效，稳定和全面的保护。