本发明涉及阻燃剂制备技术领域，具体是一种核壳型纳米微球阻燃剂及其制备方法。本发明以硅酸钠和盐酸反应后产生的原硅酸作为硅源，再加入碱和铝源偏铝酸钠，利用水热法合成纳米级硅铝酸盐沸石粉末，并在水热反应的过程中加入了硫氰化钾和柠檬酸，在硫氰化钾的作用下，通过柠檬酸的螯合性能使得纳米沸石粉末中的金属离子离开原有的晶格进入柠檬酸有机相中，从而在纳米沸石粉末的原有晶格上产生空穴，提高纳米沸石粉末的物理和化学活性，同时提高纳米沸石的吸附性能，接着本发明将纳米沸石粉末和磷酸混合反应，最终制得核壳型纳米微球阻燃剂，本发明最终的阻燃效果优异，具有广阔的应用前景。