本发明提供了一种利用水华藻固定CO2的方法，将密闭半密闭环境中含有CO2的气体通入水华藻溶液中，加入一定量的钙离子溶液，利用水华藻的生物钙化作用，促进水体中的Ca2+和CO32-结合生成CaCO3沉淀，从而固定气体中的CO2。本发明提供的利用水华藻固定CO2的方法可以降低气体中CO2的含量，实现CO2的永久固定；并且水华藻在形成水化时，对水体，水中的生物以及人类危害很大，利用水华藻固定CO2可以实现废物利用；同时水华藻光合作用还会吸收CO2增加去除率。本发明提出的固定CO2的方法操作简单、成本低廉，具有良好的环境意义。