本发明公开了具有电压谐波抑制功能的变频交流发电系统控制方法，该发电系统的发电机为定子双绕组异步发电机，它有两套定子绕组，一套为控制绕组，接有功率变换器，一套为功率绕组，输出三相变频交流电；根据负载有功信息和功率变换器直流母线电压的误差控制功率变换器输出电压的频率，根据输出电压基波分量的误差和谐波分量的误差来控制功率变换器输出电压的幅值，以改变发电机的转差频率和调节气隙磁场的幅值及谐波含量，从而保证该发电系统输出的变频交流电压稳定且正弦；该控制方法结构简单，动静态性能良好，负载适应能力较强，对线性负载和非线性负载均能适应，适合用于飞机、舰船等对独立电源系统的供电品质有较高要求的场合。