本发明公开了一种耐高温红色聚酰亚胺薄膜的制备方法，包括以下步骤：1)将热稳定剂、偶联剂、溶剂、有机红色颜料混合，进行超声搅拌处理，得到改性过后的红色溶液；2)将芳香族二胺加入溶剂溶解；3)将所述步骤1)制备的改性过后的红色溶液与所述步骤2)制备的溶解液混合，再由高速乳化泵分散；4)将芳香族二酐分批加入所述步骤3)乳化后的溶液中反应，得聚酰胺酸复合溶液；5)将所述步骤4)得到的聚酰胺酸复合溶液流涎成型，即得耐高温红色聚酰亚胺薄膜。本发明在使用有机颜料前用偶联剂和热稳定剂在溶剂中进行改性，解决了有机红色颜料耐温差的问题，同时保证了薄膜的着色效果。