本发明公开了一种检测细菌数量的方法，涉及微生物检测技术领域。所述检测细菌数量的方法，在观察计数前先对样品进行一系列的处理，再采用扫描电子显微镜进行成像计数，在一系列的处理中，固定处理避免了计数过程中细菌运动导致计数不准确的问题，同时固定处理还可以避免由于气压和电子束轰击等导致细菌结构易变形的问题；利用扫描电子显微镜成像计数，可以直接利用样品表面材料的物质性能进行微观成像，对细菌浓度没有要求，且可以放大几十到上百万倍，基本上对细菌大小没有限制，同时扫描电子显微镜自带测量尺寸的功能，可以快捷地测量细菌的尺寸，且识别率高，能够区分微生物与微小杂物，在计数时将微小杂物排除，提高了计数的准确度。