本发明公开了一种含磷马来酰亚胺树脂，所述的含磷马来酰亚胺树脂化学结构式如式1所示：所述式1中的X如下式2‑1、2‑2或式3‑1、3‑2、3‑3、3‑4结构所示：所述式1中的Y如下式4‑1、式4‑2或式5‑1、5‑2结构所示：所述式1中的R如下式6‑1、式6‑2、式6‑3、式6‑4结构所示。本发明还公开了其制备方法。本发明将磷杂化型阻燃结构与马来酰亚胺基团结合，制备出一类含磷阻燃马来酰亚胺树脂，既能解决树脂阻燃、耐热性等固有难题，同时作为阻燃剂末端含有功能性的马来酰亚胺活性基团，作为反应性阻燃剂可以与其他树脂进行反应，提高阻燃剂与材料的相容性，并提升材料的热性能、介电性能等。