一种多频干扰对间电磁耦合薄弱路径的确定方法，属于电磁兼容技术领域。本发明通过将系统中干扰源和敏感体间的电磁耦合关系转化为有向图，并使用仿真和测试的方法在不同频点处对耦合有向图的边进行赋值，然后对多个电磁干扰耦合有向图采用最短路径寻迹的方法，从中寻找出每对干扰源与敏感体在相应干扰频点处的薄弱耦合路径，最后将所有薄弱路径上的顶点按照在薄弱链路上出现的次数进行排序，最后根据排序的顺序来实现对干扰链路上的耦合通道进行整改。从而高效、准确的实现了系统电磁兼容性故障的修复和加固，可以低成本、准确、有效的解决电磁兼容问题；对系统电磁兼容性的加固和整改具有巨大的指导意义。