本发明涉及海藻藻盐制备领域，尤其是涉及一种复合海藻藻盐的制备方法及其应用。本发明分别将海发菜、龙须菜、坛紫菜、海带、裙带菜、江蓠洗净，自然晾干后放入切碎机内切成长度为小于5mm的碎片，将藻类碎片混合后再与水按1：10的质量体积比混合，室温下浸泡12‑16小时后升温，在95‑98℃条件下煮沸4‑6小时，过滤，将滤液蒸干，结晶，粉碎得复合海藻藻盐。所得藻盐中总多糖含量为10‑12%，氨基酸总含量为6‑8%，总酚类化合物含量为2‑3%。此外本发明还提供了复合海藻藻盐在压片果糖中的应用和在烘培面包中的应用。