本发明提供一种高导热中间相沥青基石墨纤维长丝的制备方法，包括以下步骤：步骤一，采用石油系中间相沥青进行熔融纺丝，喷丝孔横截面为圆形，喷丝孔直径为0.1～0.3mm，喷丝孔长度为0.2～0.4mm，得到纤维原丝；步骤二，将纤维原丝退绕到不锈钢网篮中，依次进行间歇式不熔化、炭化及连续式石墨化处理，并在石墨化处理过程中采用含硼化合物对纤维进行催化石油系中间相沥青原料具有更高导热提升潜能，采用大长径比喷丝孔结构纺制的纤维具有辐射状截面结构，具有更高的取向度，有利于导热率的提升；对于石墨化过程，利用硼元素的催化作用，可在2800℃以下制得高性能石墨纤维，适用于工程化生产。