本发明提供了一种共聚改性芳纶1313纤维的制备方法，包括以下步骤：将间苯二胺和带有极性基团的芳香族二胺溶解在酰胺类溶剂中，将混合溶液冷冻降温后与熔融的间苯二甲酰氯在低温环境下混合反应，得到共聚改性芳纶1313溶液；采用中和剂对共聚改性芳纶1313溶液进行中和除杂，得到纺丝原液；纺丝原液经过真空脱泡、过滤后，通过喷丝板，进入一级凝固浴，然后通过二级凝固浴、热水牵伸、水洗、烘干、上油、干热拉伸、热定型、冷却上油及收卷得到共聚改性芳纶1313纤维。该方法从本体上优化纤维的表面极性，避免了制成纤维后再对其表面进行修饰的复杂工艺流程，提高了生产效率；同时工艺成本低、操作简单、安全环保，适于规模化生产。