本发明涉及密封胶领域，更具体地，本发明涉及铁路无砟轨道专用双组分嵌缝防水密封胶及其制备方法。本发明第一个方面提供了一种双组分嵌缝防水密封胶，所述双组分嵌缝防水密封胶包括甲组分、乙组分以及底涂剂；按重量份计，所述甲组分包括25～50份聚醚三元醇，10～20份聚醚二元醇‑1，15～40份聚醚二元醇‑2，5～20份芳香族二异氰酸酯；按重量份计，所述乙组分包括40～80份聚醚二元醇‑3，0.01～0.1份有机锡催化剂；按重量份计，所述底涂剂包括35～55份交联剂。本发明提供的双组分嵌缝防水密封胶不含白油、沥青、废橡胶、溶剂，无味无毒，环保生态，适于用作铁路无砟轨道专用嵌缝材料，也适合于动荷载大的混凝土结构伸缩缝、变形缝、施工缝、结构缝、沉降缝中。