本发明提供了一种改性硅酮聚醚石材复合胶，包括A组分和B组分：A组分包括：80～100质量份的改性硅酮聚醚、40～60质量份的稀释剂、200～400质量份的填料、2～8质量份的触变剂、1～2质量份的抗氧化剂；B组分包括：100～200质量份的稀释剂、100～200质量份的填料、2～10质量份的除水剂、2～10质量份的粘接促进剂和1～4质量份的催化剂；粘接促进剂为包括N‑(β‑氨乙基)‑γ‑氨丙基三甲氧基硅烷和1，2‑双三甲氧基硅基乙烷的复配体；所述A组分和所述B组分的重量比为10～12：1。同时，本发明还公开了上述改性硅酮聚醚石材复合胶的制备方法。本发明提供的改性硅酮聚醚石材复合胶能够有效提高水分对湿化固化的协同效应；同时提高了胶体本身的柔韧性，显著加强了石材复合薄板的抗震、耐冲击性能。