本发明涉及新能源汽车电磁兼容测试技术领域，具体涉及一种新能源汽车电机驱动系统的电磁兼容性能测试系统，包括由第一屏蔽墙隔开的屏蔽室和半电波暗室，还包括控制室，控制室设有系统操作终端和EMI测试接收机，EMI测试接收机的电流探头和接收天线均设置在半电波暗室内；屏蔽室内设置一测功机，第一屏蔽墙上设置一屏蔽罩，一传动轴穿过屏蔽罩，传动轴一端通过联轴器与测功机的输入轴连接，联轴器上设有第一接地环，传动轴的屏蔽罩上设有第二接地环，用于将测试系统运行中产生的轴电流导入到大地；本发明可以对新能源汽车的电机驱动系统进行电磁兼容性能测试，在电机驱动系统的电磁兼容测评领域提供性价比高的设备系统，打破国外对该类设备的垄断。