本发明公开了一种发酵进气中的一氧化碳浓度控制系统及方法，所述系统包括：原料进气管线、发酵罐、尾气回流管线、控制终端和浓度控制装置；原料进气管线的进气口处设有第一检测口；发酵罐的进气口处设有第二检测口，发酵罐的出气口处设有第三检测口；尾气回流管线的出气口设于第一检测口和第二检测口之间；控制终端的第一端与第一检测口、第二检测口和第三检测口连接，控制终端的第二端与设于尾气回流管线上的浓度控制装置连接。本发明根据发酵原料气浓度、发酵尾气浓度和目标浓度生成流量需求信号，根据流量需求信号控制发酵尾气以需求流量回流至发酵原料气中，直至发酵进气的浓度达到目标浓度，从而保证了发酵进气中CO浓度的稳定性。