本发明公开了一种基于日流量的小水电微电网电源容量配置方法，先从相关数据库获取微电网中水电站一年1‑360天入库流量的历史数据，确定小水电站一年1‑360天入库流量，构建日入库流量数据集；然后计算并确定一年1‑360天微电网中小水电站入库流量按照正态分布规律变化的均值和方差；接着针对一年1‑360天入库流量变化特征，计算并确定微电网中小水电站水库入库流量按照正态分布规律变化的概率，计算微电网中小水电站入库流量平均值；最后计算小水电站小水电发电机组装机容量。本发明反映了多年日入库流量变化的概率随机性，为小水电微电网电源容量配置提供理论指导，为分布式新能源发电及智能电网调度运行提供必要的技术支撑。