本发明属于水平井分段压裂示踪监测的技术领域，具体的涉及一种油田耐高盐高碱度水溶性微量元素示踪剂的制备方法。将可溶性稀土盐与络合剂通过络合形成稀土络合物，即得该微量元素示踪剂；其中络合剂为乙二胺四乙酸、磺基水杨酸钠、羟基乙酸、氨三乙酸三钠和二乙烯三胺五乙酸五钠中的至少一种。该方法所得的微量元素示踪剂可以同时耐高碱和高矿化度。