本发明涉及一种电池系统的能量均衡电路，包括：控制模块、电池选择模块和均衡模块，均衡模块包括储能单元和开关单元，储能单元的使能端通过开关单元与控制模块相连，电池选择模块的一端与控制模块相连，电池选择模块的另一端分别与储能单元的能量传输端和开关单元相连，控制模块获取电池系统中的每个电池的电压值，比较任意两个电池的电压值的大小，得到电压差值，当电压差值大于预设阈值时，确定电压差值大于预设阈值对应的两个电池均为均衡电池，控制模块将均衡电池中的高电压对应的电池中的均衡能量存储至储能单元，然后将储能单元的能量分配至均衡电池中的低电压对应的电池，实现能量的双向均衡，提高了能量均衡的效率。