本发明提供了一种基于信号差值改善辐射电磁干扰混合信号盲源分离的方法，用于电磁兼容测试领域。本发明方法通过在各测试位置单独对背景噪声进行测试，再在各测试位置对被试品进行辐射发射测试，将二者测试信号经自适应滤波器处理得到被试品自身发射的电磁干扰混合信号，然后对得到的电磁干扰混合信号组成的信号矩阵进行差值处理，得到新的信号矩阵，对得到的新的信号矩阵利用独立分量分析方法做盲源分离。本发明改善了辐射电磁干扰信号盲源分离效果，提高了分离准确度，还提升了电磁干扰信号盲源分离的分离速度。