本发明公开了一种燃料电池膜电极的制备方法，包括：采用喷涂法将第一催化剂浆料喷涂于质子交换膜的A面；将第二催化剂浆料涂布于转印介质上，并进行干燥处理；将干燥后的转印介质与喷涂第一催化剂浆料的质子交换膜贴合，其中转印介质喷涂有第二催化剂的一面朝向质子交换膜未被喷涂的B面，在质子交换膜被喷涂第一催化剂浆料的A面覆上保护膜，采用热转印工艺，热压后剥离转印介质即得到燃料电池膜电极。本发明先喷涂后转印避免了单一超声喷涂法中不易翻转铺膜，以及质子交换膜容易卷翘的问题，提高了生产效率，避免了单一转印法中催化层与质子交换膜界面电阻较大的问题，降低了欧姆阻抗损失。