本发明提供了一种含锂复合负极材料，包括：具有核壳结构的三维骨架材料；和复合在所述三维骨架材料核壳结构中的金属锂；所述三维骨架材料以含碳负极材料为核，所述核表面覆盖有壳层；所述壳层具有多孔碳结构，且厚度大于核的粒径。本发明提供了一种含锂复合负极材料的制备方法，以及该材料在锂二次电池中的应用。本发明制得壳层厚度大于核粒径的核壳结构颗粒材料，由该颗粒材料作为三维框架，与金属锂形成三维含锂负极材料。该含锂复合负极材料可实现嵌锂/过嵌锂和锂沉积的双重活性锂的存储，提高负极比容量，扩大锂沉积面积以促进锂的均匀沉积，减少锂枝晶产生以提升安全性，控制负极的体积变化以降低电池极化。本发明方法简单，易于放大。