本发明公开了一种复合微生物有机水溶肥料，包括以下原料：复合微生物菌粉份、活性有机质、矿物质营养成分、甲壳素、磁性载体、乙醇，本申请工艺简单、性质稳定、速溶速效、混配性强、施用方便、微生物菌种纯度大、活性强、存活期长的优势，本发明还公开了所述复合微生物有机水溶肥料的制备方法，本发明可能够补充土壤有机碳源，调理土壤酸化板结，改善土壤团粒结构，增强透水透气性和土壤肥，进而加快了土壤中营养元素的移动速度，调节了作物生长的磁环境，提高了作物对养分的吸收和运转能力，从而大大的提高了肥料的利用率，具有安全、纯绿色、节省化肥、减少农药使用量、增加农作物产量、改善作物品质，降低农作物药物残留的显著优点。