本发明公开了一种促进贫辉铜矿生物柱浸的方法，具体公开了一种基于复合硫氧化菌和黄铁矿外源干预协同促进贫辉铜矿生物柱浸的方法，属于生物工程技术领域。本发明在以9K‑辉铜矿复合培养基作为浸出液，通过添加一定比例黄铁矿和引入外源复配硫氧化菌剂，调控浸出过程各种生化反应的进行，促进浸出过程中的铁硫代谢，降低铁/硫钝化膜的形成；通过分批补加复合硫氧化菌体强化浸出过程生物效应，从而将铜离子浸出率提高33.9％。此方法操作简便易行，经济合理，适用于类似生物浸出过程的大规模推广应用。