本发明属于保健食品、功能性食品技术领域，具体涉及一种供肠胃不佳人群食用的含肽组合物及其应用。本发明所述组合物牛骨低聚肽粉、薏苡仁蛋白肽粉、鸡内金粉为主要成分，辅以菊粉、L‑阿拉伯糖、聚葡萄糖等功能性多糖和复合维生素、食用香精、甜味剂等制备成一种供肠胃不佳人群食用的含肽组合物，所述组合物具有促进肠胃蠕动、改善便秘、健脾胃、助消化的功效，调理肠胃不佳的效果显著。