本发明公开了一种富硒米酒制备方法。以普通糯米为主要原料，以普通甜酒制作工艺为基础，将糖化过程和发酵过程分开进行，在发酵过程中添加富硒酵母进行发酵。使用干糯米质量1.3％的根霉Q303酒曲糖化、糖化时间17h；使用0.15％～0.7％的富硒酵母、9％的蔗糖和100％的凉白开混合发酵，发酵时间26～30h；将发酵好的米酒75℃灭菌30min，灭菌完成后密封保存在低温避光处。所得米酒总硒含量可达41.3～362μg/100g。本发明通过调节富硒酵母添加量和发酵时间，可应用于补硒甜酒和补硒药品的研发。