本发明涉及一种小龙虾专用脂肪粉及其制备方法和应用，所述小龙虾专用脂肪粉按重量份数计包括：复合Ω3功能性脂肪酸酯10‑30份、酵母提取物5‑20份和载体30‑65份。本发明通过将特定重量配比的复合Ω3功能性脂肪酸酯、酵母提取物和载体混合作为小龙虾专用脂肪粉添加入基础饲料，通过营养摄入的方式提升小龙虾免疫力，改善小龙虾生长性能，节约资源，保护水质，提高经济效益。且添加有该脂肪粉的饲料性质稳定，不易发生油脂酸败，在加工和贮藏过程中，不易出现苦涩和营养价值降低的情况。