本发明属于生物工程技术领域，公开了一种正十六烷降解菌YJ1及其应用。本发明分离筛选得到一株以正十六烷为碳源的降解菌株，根据菌株形态、生理特征、革兰氏染色反应、16SrDNA基因测序分析及系统发育分析，鉴定该菌株为硝化短芽孢杆菌Brevibacillusnitrificans，并将其命名为YJ1。该菌株已于2019年8月保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏号为CGMCCNO.18418，该菌能够利用正十六烷作为唯一碳源并且很快地将其降解：在正十六烷初始浓度为10mg/L环境下培养15天后，降解率可达66.7％。该菌株的最适生长条件为30℃、pH＝7、接种量10％。本发明的菌株对正十六烷具有较好的降解特性，并且不会对环境造成二次污染。