本发明提供了一种降低断奶仔猪腹泻的饲用酶制剂，该饲用酶制剂包括复合酶、茶多酚和载体，所述复合酶包括2000U/g葡萄糖氧化酶、3000U/g淀粉酶、8000U/g酸性蛋白酶、2000U/g酸性甘露聚糖酶和10000U/g木聚糖酶，所述载体包括玉米淀粉、石粉、麦饭石或米糠中的一种或几种。其制备方法包括如下步骤，复合酶制剂的各组分按配比称取后，先将复合酶的各组分混匀后，再与茶多酚和载体一同加入双轴高效混合机内混合，混合时间为10min～15min，混合后对成品进行混匀度检测，确保变异系数≤5％。本发明具有提高断奶仔猪的生长性能，降低料肉比和腹泻率，且本发明的饲用酶制剂为绿色环保添加剂。