本发明公开了一种基于特定培养基组成的筛选平板和细胞微孔板结合的4‑α‑糖基转移酶(4GT)高产菌株的高效高通量筛选方法，属于生物工程技术领域。本发明包括高通量平板初筛方法的建立；高通量平板初筛方法的优化；4GT基因的易错PCR法诱变；菌株的基于细胞微孔板的高通量平板初筛；菌株的摇瓶复筛。本发明对传统的筛选方法进行了改进，有效地减低了工作强度，提高了高产菌株的筛选效率。