本发明涉及一种酸奶中低聚异麦芽糖及其同分异构体的分析方法，通过应用超高效液相色谱‑离子淌度‑三重四级杆质谱串联飞行时间质谱技术，使用HMSE模式对样品进行采集，使用一级和二级离子碎片进行定量，使用保留时间和离子趟度漂移时间进行定性，多个维度准确分析酸奶中的麦芽糖、麦芽三糖和异麦芽糖、潘糖及异麦芽三糖，建立了酸奶中低聚异麦芽的UPLC‑IMS‑QTof方法，填补该领域的空白，为该行业工作者提供更高效精准的分析方法，为检测市面酸奶的低聚糖含量提供技术支持。