本发明公开了一种真菌发酵同步偶联果汁脱涩的方法，通过制备固定化真菌装置，将果汁灭菌后流经所述固定化真菌装置，使得果汁脱涩，利用果汁流经所述固定化真菌装置时，果汁中的酚类物质刺激真菌代谢漆酶，同时真菌代谢的漆酶使果汁脱涩。本发明方法利用真菌直接代谢产漆酶的功能微生物发酵果蔬汁，无需对酶进行分离纯化，可实现连续化加工，果蔬汁中的酚类物质还可调控真菌代谢漆酶的能力，提高漆酶利用率，降低成本，有效脱除果蔬汁苦涩味，同时由于本方法采用具有木质素降解能力的功能微生物发酵，可以将糖、氨基酸等营养成份转化成功能多糖、活性蛋白等成份。