本发明涉及一种富有机硒葛仙米的培养方法，包括1)利用富硒固体培养基将蛹虫草菌种培养成富硒蛹虫草子实体；2)酶解采用胶体磨将所述富硒蛹虫草子实体磨成的菌浆，获得富含硒代氨基酸的富硒原液；3)利用富硒液体培养基将对数生长期的葛仙米驯化培养成适应富硒培养的葛仙米藻体；4)诱导培养适应富硒培养的葛仙米藻体，获得富有机硒的葛仙米。本发明利用酶解及活性炭吸附处理经多级生物转化的植物活性硒而获得的硒代氨基酸作为培养富硒葛仙米的硒源，有效地提高富硒葛仙米的食用安全性。在培养后期在营养及光质的协同诱导作用下，增强葛仙米的光合能力，促进葛仙米蛋白质的合成，提高葛仙米对富硒液体培养基中硒代氨基酸的利用率，从而提高葛仙米中的硒含量而获得富有机硒的葛仙米。