本发明公开了一种调节头皮菌群平衡的中药组方，包含当归、侧柏叶、苦参、厚朴、月季，其中，所述当归的重量配比为6～12份、所述侧柏叶的重量配比10～20份、所述苦参的重量配比20～30份、所述厚朴的重量配比20～30份、所述月季重量比20～30份。本发明还提出了所述组方的制备方法。本发明克服传统工艺制备中药提取液存在的颜色深、有效成分保留少、杂质多等问题。本发明还提出了所述中药组方具有平衡头皮菌群微生态的应用。