本发明属于生物工程技术领域，具体涉及一种基因工程菌及以D,L‑扁桃酸为底物制备L‑苯甘氨酸的方法。该基因工程菌包含密码子优化后的扁桃酸消旋酶、D‑扁桃酸脱氢酶和L‑亮氨酸脱氢酶，3种酶可共表达，且表达量明显大于密码子优化前，将该基因工程菌用于催化D,L‑扁桃酸制备L‑苯甘氨酸时，无需添加辅助因子，且转化率和催化效率高。