本实用新型属于蔗汁处理设备领域，公开了一种甘蔗汁中蛋白质提取系统。所述提取系统包括依次连接的气浮装置、超声辅助提取装置、碱提液固液分离装置、酸处理固液分离装置和冷冻干燥装置；其中气浮装置的浮渣排出口与超声辅助提取装置连接；所述超声辅助提取装置的碱提液出口与碱提液固液分离装置连接；所述碱提液固液分离装置的液相出口与酸处理固液分离装置连接；所述酸处理固液分离装置的蛋白质沉淀物出口与冷冻干燥装置连接。本实用新型的处理系统可把蔗汁中蛋白质物质提取与制糖清净工艺有机结合，在提取蛋白质物质的同时解决糖液脱色和工艺连续性的问题。