本发明公开了一种采用新型低共熔溶剂预处理秸秆发酵丁醇的方法，属于生物工程技术领域。本发明用乳酸为氢键供体和乙胺盐酸盐为氢键受体合成的新型供体低共熔溶剂预处理秸秆，然后添加纤维素酶酶解，再利用酶解液作为碳源，发酵丁醇。在预处理水稻秸秆过程中具有较高的半纤维素去除率(73.2％)和木质素去除率(55.7％)，酶解后总糖浓度可达59g/L，其中葡萄糖浓度为58.3g·L–1，相比之前采用氯化胆碱:甲酸:乙酸的离子液体(42g/L)具有较大提升。整个过程具有成本低、三废少等优点。并且预处理后的秸秆水解液可以用来发酵生产丁醇。