本发明属于生物工程技术领域，提供了一种高效生物降酚菌剂及其应用方法，该复合菌剂由两种菌组成，所述菌株分离自含酚污水处理系统，经过16SrDNA鉴定分别为产碱菌和蜡样芽孢杆菌，两个菌株保藏编号分别为CGMCCNO.16158和CGMCCNO.16157，应用时，根据污水系统中进水挥发酚的含量，将产碱菌与蜡样芽孢杆菌菌粉按重量比1‑3:1混合活化，然后按照1:100‑1000的体积比接种于好氧污泥中，12小时内的降酚能力达99％。本发明的菌种易于培养扩繁，制备为固体菌粉，便于运输与储存，在使用时可根据进水水质的情况选择添加菌粉的量及比例，菌种分离自污水处理系统中环境适应性强、耐酚能力强、降解浓度高、降解速度快、不易造成二次污染。