本发明公开一种多层微波加热和灭菌的真空带式干燥机及其玉米浆的干燥和灭菌的方法，它包括罐体，所述罐体内由上至下间隔设置有多排相互平行且水平的循环输送皮带，所述循环输送皮带两端均设置有输送滚筒，所述输送滚筒之间的循环输送皮带上装置有微波加热灭菌装置，所述循环输送皮带一端上方对应设置有进料喷头，所述进料喷头中部设置在进料转轴上，所述进料喷头另一端通过进料软管与罐体外的进料泵连接，所述循环输送皮带另一端下方设置有出料绞龙。本发明在使用微波加热装置后，设备的生产效率将大大提高，将真空带式干燥机的加热强度提高很多倍，单位加热面积的脱水量甚至提高10倍。