本发明提供一种磁性固体碱催化剂合成聚甘油脂肪酸酯的方法。该方法，包括以下步骤，将聚甘油、脂肪酸和磁性固体碱催化剂置于反应容器中搅拌，在惰性气氛下升温至120‑160℃，保温，再将温度直接升到180‑220℃，反应2‑4h结束后停止加热，保持在惰性气氛保护中继续搅拌，降温到160℃以下时，用磁体回收磁性固体碱催化剂，产物自然冷却即得到聚甘油脂肪酸酯。本发明中以疏水性介孔磁性固体碱催化剂来合成聚甘油脂肪酸酯，该磁性固体碱催化剂便于从高粘度的反应体系中分离，同时聚甘油脂肪酸酯的产率高达89％。