本发明属于环境生物工程技术领域，具体的涉及一种垃圾、厕所微生物除臭剂及制备方法。本发明微生物包括芽孢杆菌群、乳酸菌群、酵母菌群等有益菌群，可以有效除臭和抑制有害菌群生长繁殖，预防某些病虫危害，维持圈舍、垃圾场、厕所微生态平衡。微生物菌剂中的酵母菌能够分泌活性物质，促进有益微生物生长，本身能够产生香气；乳酸菌能够使有机质发酵，调节pH，抑制有害菌生长；芽孢杆菌能够产生酶类，抑制、吸收、利用、转化恶臭气体物质及除臭。本发明环保高效、成本低、制备方法简便，具有良好的应用价值与环保意义。